Im Jahr 1775 schrieb der Marquis de Sade darüber: „Ich habe nie etwas Beeindruckenderes gesehen.“ Zugegeben, die Krypta war nach seinem Geschmack.
Mark Twain schrieb darüber in seinem 1869 erschienenen Buch Innocents Abroad. Als Twain einen der Mönche fragte, was passieren würde, wenn er stirbt, antwortete der Mönch: „Wir müssen alle hier liegen.“ Und dort liegen sie auch. Etwa 4.000 Kapuziner, die zwischen 1528 und 1870 starben, liegen, hängen und schmücken noch immer die Krypta von Santa Maria della Concezione in Rom.
Im Jahr 1631 verließen die Kapuziner, so genannt wegen der „capuche“ oder Kapuze, die an ihrem Ordenshabit befestigt war, das Kloster von St. Bonaventura in der Nähe des Trevi-Brunnens und kamen nach Santa Maria della Concezione, von dem nur noch die Kirche und die Krypta übrig sind. Auf Anweisung von Kardinal Antonio Barberini (Bruder des Papstes und Mitglied des Kapuzinerordens) brachten sie die sterblichen Überreste der verstorbenen Brüder mit in ihr neues Heim, damit alle Kapuziner an einem Ort sein konnten.
Anstatt die Überreste ihrer toten Brüder einfach zu begraben, schmückten die Mönche die Wände der Krypta mit ihren Gebeinen, um sich daran zu erinnern, dass der Tod jederzeit kommen konnte. Auf einer Tafel in der Krypta ist zu lesen: „Was ihr jetzt seid, waren wir einst; was wir jetzt sind, werdet ihr sein.“
Das Beinhaus enthält eine Krypta mit Schädeln, eine Krypta mit Beinknochen und die vielleicht seltsamste – eine „Krypta mit Becken“. Mumifizierte Mönche waren in Mönchskleidung gekleidet und hingen an den Wänden und der Decke. Mit dem Einzug der Elektrizität wurden in einige der hängenden Mönche Beleuchtungskörper eingebaut, was dem Ausdruck „das ewige Licht“ eine neue Bedeutung verlieh.
Ein besonderes Highlight der Krypta ist das in einem Oval aus Knochen eingeschlossene Skelett, das eine Sense und eine Waage hält – Werkzeuge, die vollständig aus, ja, Knochen bestehen. Die Krypta soll als Inspiration für das Beinhaus von Sedlec in Tschechien gedient haben.