Der militärische Einsatz sollte im Oktober 1932 beginnen. Der „Krieg“ wurde unter dem Kommando von Major G. P. W. Meredith von der Seventh Heavy Battery der Royal Australian Artillery geführt, wobei Meredith die Soldaten Sergeant S. McMurray und Gunner J. O’Halloran befehligte, die mit zwei Lewis-Gewehren und 10.000 Schuss Munition bewaffnet waren. Die Operation wurde jedoch durch eine Regenperiode verzögert, die die Emus dazu veranlasste, sich über ein größeres Gebiet zu verstreuen. Der Regen hörte am 2. November 1932 auf, woraufhin die Truppen mit dem Befehl eingesetzt wurden, den Farmern zu helfen und, laut einem Zeitungsbericht, 100 Emu-Häute zu sammeln, damit ihre Federn zur Herstellung von Hüten für leichte Reiter verwendet werden konnten.
Erster Versuch
Am 2. November fuhren die Männer nach Campion, wo etwa 50 Emus gesichtet wurden. Da die Vögel außerhalb der Reichweite der Geschütze waren, versuchten die einheimischen Siedler, die Emus in einen Hinterhalt zu treiben, aber die Vögel teilten sich in kleine Gruppen auf und liefen davon, so dass sie schwer zu treffen waren. Während die erste Salve aus den Maschinengewehren aufgrund der Reichweite unwirksam war, konnte eine zweite Salve jedoch „eine Anzahl“ von Vögeln töten. Später am selben Tag wurde ein kleiner Schwarm angetroffen und „vielleicht ein Dutzend“ Vögel wurden getötet.
Das nächste bedeutende Ereignis war am 4. November. Meredith hatte einen Hinterhalt in der Nähe eines örtlichen Staudamms eingerichtet, und mehr als 1.000 Emus wurden gesichtet, die auf ihre Position zusteuerten. Diesmal warteten die Kanoniere, bis die Vögel in unmittelbarer Nähe waren, bevor sie das Feuer eröffneten. Das Gewehr klemmte, nachdem nur zwölf Vögel getötet worden waren, und der Rest verstreute sich, bevor noch mehr geschossen werden konnten. An diesem Tag wurden keine weiteren Vögel gesichtet.
In den folgenden Tagen entschied sich Meredith, weiter nach Süden zu ziehen, wo die Vögel „angeblich ziemlich zahm“ waren, aber trotz seiner Bemühungen war der Erfolg nur begrenzt. Am vierten Tag der Kampagne stellten die Armeebeobachter fest, dass „jedes Rudel jetzt seinen eigenen Anführer zu haben scheint – einen großen schwarz gefiederten Vogel, der bis zu sechs Fuß hoch steht und Wache hält, während seine Kameraden ihr Zerstörungswerk verrichten und sie vor unserer Annäherung warnen“. Einmal ging Meredith sogar so weit, eines der Geschütze auf einen Lastwagen zu montieren, was sich jedoch als uneffektiv erwies, da der Lastwagen nicht in der Lage war, an die Vögel heranzukommen, und die Fahrt so rau war, dass der Schütze keine Schüsse abgeben konnte. Bis zum 8. November, sechs Tage nach dem ersten Einsatz, waren 2.500 Schuss Munition verschossen worden. Die Zahl der getöteten Vögel ist ungewiss: Ein Bericht schätzt, dass es 50 Vögel waren, aber andere Berichte reichen von 200 bis 500, wobei die letztere Zahl von den Siedlern angegeben wurde. Merediths offizieller Bericht vermerkte, dass seine Männer keine Verluste erlitten hatten.
Zusammenfassend kommentierte der Ornithologe Dominic Serventy die Tötungen:
Die Träume der Maschinengewehrschützen, aus nächster Nähe auf die in Reih und Glied stehenden Emus zu schießen, zerschlugen sich bald. Das Emu-Kommando hatte offensichtlich Guerilla-Taktik befohlen, und seine schwerfällige Armee zersplitterte bald in unzählige kleine Einheiten, die den Einsatz der militärischen Ausrüstung unwirtschaftlich machten. Eine niedergeschlagene Feldtruppe zog sich daher nach etwa einem Monat aus dem Kampfgebiet zurück.
Am 8. November diskutierten die Mitglieder des australischen Repräsentantenhauses über die Operation. Nach der negativen Berichterstattung in den lokalen Medien, die unter anderem behauptete, dass „nur ein paar“ Emus gestorben seien, zog Pearce am 8. November das Militärpersonal und die Waffen ab.
Nach dem Abzug verglich Major Meredith die Emus mit Zulus und kommentierte die auffallende Wendigkeit der Emus, selbst wenn sie schwer verwundet waren.
Wenn wir eine Militärdivision mit der kugeltragenden Kapazität dieser Vögel hätten, würde sie es mit jeder Armee der Welt aufnehmen … Sie können Maschinengewehren mit der Unverwundbarkeit von Panzern entgegentreten. Sie sind wie Zulus, die selbst Dum-Dum-Kugeln nicht aufhalten könnten.
Zweiter Versuch
Nach dem Abzug des Militärs gingen die Emu-Angriffe auf die Ernten weiter. Die Farmer baten erneut um Unterstützung und beriefen sich auf das heiße Wetter und die Trockenheit, die dazu führten, dass die Emus zu Tausenden in die Farmen eindrangen. James Mitchell, der Premierminister von Westaustralien, unterstützte die Erneuerung der Militärhilfe nachdrücklich. Gleichzeitig wurde ein Bericht des Stützpunktkommandanten herausgegeben, der angab, dass 300 Emus bei der ersten Operation getötet worden waren.
Auf die Bitten und den Bericht des Stützpunktkommandanten hin genehmigte der Verteidigungsminister am 12. November die Wiederaufnahme der militärischen Bemühungen. Er verteidigte die Entscheidung im Senat und begründete, warum die Soldaten notwendig waren, um die ernste landwirtschaftliche Bedrohung durch die große Emu-Population zu bekämpfen. Obwohl das Militär zugestimmt hatte, die Gewehre an die westaustralische Regierung zu verleihen, in der Erwartung, dass diese die notwendigen Leute zur Verfügung stellen würde, wurde Meredith erneut ins Feld geschickt, da es im Bundesstaat offensichtlich an erfahrenen Maschinengewehrschützen mangelte.
Am 13. November 1932 nahm das Militär den Einsatz auf und hatte an den ersten beiden Tagen einen gewissen Erfolg, wobei etwa 40 Emus getötet wurden. Der dritte Tag, der 15. November, erwies sich als weit weniger erfolgreich, aber bis zum 2. Dezember töteten die Soldaten etwa 100 Emus pro Woche. Meredith wurde am 10. Dezember zurückgerufen, und in seinem Bericht behauptete er 986 Tötungen mit 9.860 Schuss, bei einer Rate von genau 10 Schuss pro bestätigter Tötung. Darüber hinaus behauptete Meredith, dass 2.500 verwundete Vögel an den Folgen ihrer Verletzungen gestorben seien. Ein Artikel im Coolgardie Miner vom 23. August 1935 bewertete den Erfolg der Keulung: Obwohl der Einsatz von Maschinengewehren „in vielen Kreisen kritisiert wurde, erwies sich die Methode als effektiv und rettete, was vom Weizen übrig blieb“.