Viele Flaggen wurden in der jahrtausendealten Geschichte Ägyptens gehisst, aber die erste echte Nationalflagge wurde erst am 16. Februar 1915 eingeführt, nachdem die Briten, die das Land seit 1882 faktisch kontrollierten, formell ein Protektorat ausriefen, um die Wiederherstellung der nominellen Bindungen Ägyptens an das Osmanische Reich zu verhindern. Die zuvor vom Khedive (dem osmanischen Vizekönig in Ägypten) verwendete Flagge wurde zur Nationalflagge; sie war rot mit drei weißen Halbmonden und Sternen. Die Teilnehmer des Aufstandes von 1919 hissten eine grüne Flagge mit weißem Halbmond und Kreuz, um die Einheit zwischen Muslimen und Christen im Kampf um die Unabhängigkeit zu demonstrieren. Eine ähnliche Flagge mit drei weißen Sternen anstelle des Kreuzes wurde am 10. Dezember 1923 nach der Ausrufung des Königreichs Ägypten angenommen.
Der Aufstand von 1952 etablierte die arabische Befreiungsflagge, die rot-weiß-schwarze Querstreifen und einen goldenen Adler hatte. Diese Flagge wurde oft neben der Nationalflagge gehisst, hatte aber selbst keinen offiziellen Status; dennoch spiegelte sich ihr Design in der offiziellen Nationalflagge der Vereinigten Arabischen Republik von 1958 wider, wo der goldene Adler durch zwei grüne Sterne ersetzt wurde, um die Vereinigung von Ägypten und Syrien zu symbolisieren. Man ging davon aus, dass sich die Anzahl der Sterne erhöhen würde, wenn weitere arabische Staaten der Union beitreten würden. Tatsächlich löste sich Syrien von der Union, obwohl Ägypten die Flagge nicht änderte, um dies zu reflektieren. Am 1. Januar 1972 wurde die Konföderation der Arabischen Republiken zwischen Ägypten, Syrien und Libyen gegründet. Die Sterne wurden durch den goldenen Falken von Quraysh ersetzt, dem Symbol des Stammes, dem der Prophet Muhammad angehört hatte. Schließlich wurde am 9. Oktober 1984, fünf Jahre nach der Auflösung der Föderation, der goldene Adler von Saladin, dem Herrscher von Ägypten, Syrien, Jemen und Palästina aus dem 12. Jahrhundert, anstelle des Falken angebracht.