Die Sargassosee wird in der Literatur und in den Medien oft als ein Gebiet des Geheimnisses dargestellt.
Ezra Pounds „Portrait d’une Femme“ beginnt mit der Zeile: „Your mind and you are our Sargasso Sea“, was darauf hindeutet, dass die Frau, die in dem Gedicht angesprochen wird, ein Hort von Belanglosigkeiten und unzusammenhängenden Fakten ist.
Die Sargassosee taucht in klassischen Fantasy-Geschichten von William Hope Hodgson auf, etwa in seinem Roman „The Boats of the „Glen Carrig““ (1907), Victor Appletons Roman „Don Sturdy in the Port of Lost Ships: Or, Adrift in the Sargasso Sea, und mehrere verwandte Kurzgeschichten. Jules Vernes Zwanzigtausend Meilen unter dem Meer beschreibt die Sargassosee und gibt einen Bericht über ihre Entstehung.
Die Sargassosee wird in der Fiktion häufig (aber fälschlicherweise) als gefährliches Gebiet dargestellt, in dem Schiffe jahrhundertelang im Unkraut versinken und nicht entkommen können. Der 1933 veröffentlichte Doc Savage-Roman The Sargasso Ogre spielt in der Sargasso, in der noch Nachfahren elisabethanischer Piraten leben. Eine ähnliche Geschichte erscheint in Green Lantern (Bd. 1) Nr. 3 (Frühjahr 1942), „The Living Graveyard of the Sea“ (Der lebende Friedhof des Meeres), die sich auf einen angeblich mythischen Ort bezieht. Hier leben die Nachfahren vieler verschiedener Schiffstypen in utopischer Harmonie, bis sie von Nazis angegriffen werden, die dies zu ihrem Vorteil nutzen wollen. In der ersten Folge von Jonny Quest, „Das Geheimnis der Eidechsenmänner“, operiert ein Spionagering im Sargasso, unter den (nicht existierenden) verlassenen Schiffen. Der Film „The Lost Continent“ von Hammer Film Productions aus dem Jahr 1968 (basierend auf dem Roman „Uncharted Seas“ von Dennis Wheatley aus dem Jahr 1938) zeigt Reisende, die sich in einer Sargassosee verirrt haben, die von fleischfressenden Algen und riesigen Krustentieren befallen ist, und Nachfahren spanischer Eroberer, die über andere gefangene Menschen herrschen, die wiederum Nachfahren derer sind, die Jahrhunderte zuvor im Unkraut versunken sind. Diese Darstellungen werden in der The Venture Bros. Staffel 1-Episode „Ghosts of the Sargasso“ parodiert, die in den sich überschneidenden Gebieten der Sargassosee und des Bermuda-Dreiecks spielt und von vermeintlichen Piraten handelt, deren Schiff ein Jahrzehnt lang im Sargassum festsaß, sowie vom Geist des Piloten eines experimentellen Flugzeugs, das 1969 ins Meer stürzte. Die Sargassosee ist ein zentraler Schauplatz in „Indiana Jones und die Sargassopiraten“, einer 1995 erschienenen limitierten Comicserie von Dark Horse. Der Abenteurer, der sich auf dem Meer verirrt hat, wird an eine „Stadt“ aus verlassenen Schiffen aus der gesamten maritimen Geschichte angespült, die von dichtem Seegras eingeschlossen und umspült wird. Die Schiffe sind von Piraten bevölkert und in den Gewässern wimmelt es von Aalen.
Wide Sargasso Sea (1966) von Jean Rhys ist eine Neufassung von Charlotte Brontës Jane Eyre aus der Sicht von Bertha Mason.
The Sargasso Sea wird in dem Dead Can Dance Song „All in Good Time“ aus ihrem 2012er Album Anastasis referenziert.
Die Sargassosee wird im Refrain von Andrew Birds Song „Left-Handed Kisses“ (featuring Sängerin Fiona Apple) vom April 2016 erwähnt.
Der Schriftsteller Charles Fort stellte die Hypothese auf, dass es eine „Super-Sargassosee“ gibt, einen Ort, an den alle verlorenen Dinge gehen. Das Popkultur-Wiki TV Tropes kennt einen gleichnamigen Trope.
Die Ein-Mann-Band Lemon Demon bezieht sich in dem Song „Touch-Tone Telephone“, der auf ihrem 2016 erschienenen Album Spirit Phone veröffentlicht wurde, ebenfalls auf die Super-Sargasso Sea.
Die Sargassosee wird in der 2019 erschienenen Episode „Silky Love“ des Radiolab-Podcasts als der Ort erwähnt, an dem Aale wandern und sich fortpflanzen.
Die Sargassosee wird als Analogie in dem Roman Zen and the Art of Motorcycle Maintenance, von Robert M. Pirsig, wenn er beschreibt, wie die Rhetorik als Disziplin „ein riesiger Sargasso stagnierender Logik“ sein kann.
Im Video zum Song „Dashboard“ von Modest Mouse aus dem Jahr 2007 ist die Sargassosee auf einer Karte und als angeblicher Schauplatz der im Video dargestellten Ereignisse zu sehen.
Sargasso Sea ist auch der Titel eines Albums der Gitarristen John Abercrombie und Ralph Towner, das 1976 bei ECM erschienen ist (ECM 1080)