En 1935, Robert Broom trouve les premiers fossiles d’hommes-singes à Sterkfontein et commence à travailler sur ce site. En 1938, un jeune écolier, Gert Terrblanche, apporte à Raymond Dart les fragments d’un crâne provenant de la Kromdraai voisine, qui seront plus tard identifiés comme Paranthropus robustus. Toujours en 1938, une seule dent d’homme-singe a été découverte sur le site de Cooper, entre Kromdraai et Sterkfontein. En 1948, l’expédition américaine Camp-Peabody a travaillé à Bolts Farm et Gladysvale à la recherche d’hominidés fossiles, mais n’en a trouvé aucun. Plus tard en 1948, Robert Broom a identifié les premiers restes d’hominidés dans la grotte de Swartkrans. En 1954, C.K. Brain a commencé à travailler sur des sites du Berceau, dont Cooper’s Cave. Il a ensuite commencé à travailler pendant trois décennies dans la grotte de Swartkrans, ce qui a permis de récupérer le deuxième plus grand échantillon de restes d’hominidés du Berceau. La plus ancienne utilisation contrôlée du feu par l’Homo erectus a également été découverte à Swartkrans et datée de plus d’un million d’années.
En 1966, Phillip Tobias a commencé ses fouilles de Sterkfontein qui se poursuivent encore et sont les plus longues fouilles de fossiles en continu au monde. En 1991, Lee Berger, de l’université de Witwatersrand, découvre les premiers spécimens d’hominidés sur le site de Gladysvale, ce qui en fait le premier nouveau site d’hominidés précoces découvert en Afrique du Sud depuis 48 ans. En 1994, Andre Keyser a découvert des hominidés fossiles sur le site de Drimolen. En 1997, Kevin Kuykendall et Colin Menter de l’Université de Witwatersrand ont trouvé deux dents d’hominidés fossiles sur le site de Gondolin. Toujours en 1997, Ron Clarke découvre le squelette presque complet d’australopithèque « Little Foot », datant d’environ 3,3 millions d’années (bien que des datations plus récentes suggèrent qu’il est plus proche de 2,5 millions d’années). En 2001, Steve Churchill de l’Université Duke et Lee Berger ont trouvé des restes humains des débuts de l’ère moderne à Plovers Lake. Toujours en 2001, les premiers fossiles d’hominidés et outils en pierre ont été découverts in situ à Coopers. En 2008, Lee Berger a découvert sur le site fossilifère de Malapa les restes partiels de deux hominidés (Australopithecus sediba) qui vivaient il y a entre 1,78 et 1,95 million d’années.
En octobre 2013, Berger a chargé le géologue Pedro Boshoff d’étudier les systèmes de grottes du berceau de l’humanité dans le but exprès de découvrir d’autres sites d’hominidés fossiles. Les spéléologues Rick Hunter et Steven Tucker ont découvert des fossiles d’hominidés dans une zone jusqu’alors inexplorée du système de grottes Rising Star/Westminster, assignée à la désignation de site UW-101. En novembre 2013, Berger a dirigé une expédition conjointe de l’Université du Witwatersrand et de la National Geographic Society dans le Rising Star Cave System près de Swartkrans. En seulement trois semaines de fouilles, l’équipe internationale de six femmes spéléologues de pointe (K. Lindsay Eaves, Marina Elliott, Elen Feuerriegel, Alia Gurtov, Hannah Morris et Becca Peixotto), choisies pour leurs compétences en paléoanthropologie et en spéléologie, ainsi que pour leur petite taille, a récupéré plus de 1 200 spécimens d’une espèce d’hominine fossile actuellement non identifiée. Le site est encore en cours de datation. En septembre 2015, Berger, en collaboration avec National Geographic, a annoncé la découverte d’une nouvelle espèce de parent humain, nommée Homo naledi, dans le site UW-101. Le plus remarquable est qu’en plus de faire la lumière sur les origines et la diversité de notre genre, H. naledi semble également avoir déposé intentionnellement les corps de ses morts dans une chambre de grotte éloignée, un comportement que l’on pensait auparavant limité aux humains. Au cours des derniers jours de l’expédition Rising Star, les spéléologues Rick Hunter et Steven Tucker ont découvert d’autres fossiles d’hominidés dans une autre partie du réseau de grottes. Les fouilles préliminaires sur ce site, désigné UW-102, ont commencé et ont permis de découvrir du matériel fossile d’hominidés complet. On ignore quelle est la relation entre les sites 101 et 102.