IntroductionLes colorations à l’hématoxyline et à l’éosine (H&E) sont utilisées depuis au moins un siècle et sont toujours essentielles pour reconnaître les différents types de tissus et les changements morphologiques qui constituent la base du diagnostic contemporain du cancer. Cette coloration est restée inchangée pendant de nombreuses années parce qu’elle fonctionne bien avec une variété de fixateurs et affiche un large éventail de caractéristiques cytoplasmiques, nucléaires et de la matrice extracellulaire. L’hématoxyline a une couleur bleu-violet profond et colore les acides nucléiques par une réaction complexe et incomplètement comprise. L’éosine est rose et colore les protéines de manière non spécifique. Dans un tissu typique, les noyaux sont colorés en bleu, tandis que le cytoplasme et la matrice extracellulaire présentent des degrés variables de coloration rose. Les cellules bien fixées présentent des détails intranucléaires considérables. Les noyaux présentent des modèles de condensation de l’hétérochromatine (coloration à l’hématoxyline) qui varient selon le type de cellule et le type de cancer et qui sont très importants pour le diagnostic. Les nucléoles sont colorés à l’éosine. Si des polyribosomes abondants sont présents, le cytoplasme aura une coloration bleue distincte. La zone de Golgi peut être identifiée provisoirement par l’absence de coloration dans une région proche du noyau. Ainsi, la coloration révèle d’abondantes informations structurelles, avec des implications fonctionnelles spécifiques. Une limitation de la coloration à l’hématoxyline est qu’elle est incompatible avec l’immunofluorescence. Il est cependant utile de colorer une section sérielle de paraffine d’un tissu dans lequel une immunofluorescence sera effectuée. L’hématoxyline, généralement sans éosine, est utile comme contre-coloration pour de nombreuses procédures d’immunohistochimie ou d’hybridation qui utilisent des substrats colorimétriques (comme la phosphatase alcaline ou la peroxydase). Ce protocole décrit la coloration H&E de coupes de tissus et de cellules.