Op 12-jarige leeftijd werd de jonge bruid al beschouwd als een grote schoonheid. Sinds de dood van zijn vader een jaar eerder, was de 24-jarige Edward II nu koning. Maar hij toonde weinig belangstelling voor Isabella. Zijn eerste daad als koning was het terugroepen van de verbannen Piers Gaveston. Een kroniekschrijver schreef: “Hij had zijn grootste liefde thuis.”
Wat hun relatie ook precies was, Edward II beschouwde Gaveston met grote genegenheid. Vanaf het begin van zijn huwelijk met Isabella was hun relatie niet goed. Edward had geen romantische belangstelling voor Isabella. Isabella kwam er al snel achter dat haar man haar geen geld gaf. Ze schreef naar haar vader om hem te vertellen dat ze in armoede leefde. Koning Filips schreef snel terug en eiste dat Edward voor zijn vrouw en eventuele kinderen zou zorgen. Edward hield zijn antwoord tegen door uitvluchten te zoeken. Intussen ontdekte Isabella dat Piers Gaveston veel van de juwelen had gekregen die haar vader haar had gegeven als deel van haar bruidsschat. Isabella was woedend. Haar ooms waarschuwden Edward dat ze hun kroning niet zouden bijwonen tenzij hij zich van Gaveston zou ontdoen. Maar Edwards baronnen hadden dezelfde dreigementen al geuit. Edward beloofde dat hij alles zou regelen als het parlement in maart bijeen zou komen. Toen Gaveston de leiding kreeg over de kroning, ging het ene na het andere mis. Bij het banket ter ere van de koning en de koningin zat Gaveston naast de koning in plaats van naast Isabella. Hij toonde zelfs zijn wapenschild naast dat van de koning in plaats van dat van Isabella. De baronnen en Isabella’s verwanten waren woedend over deze beledigingen aan het adres van hun nieuwe koningin. Maar pas in 1311 stelden de baronnen een lijst van verordeningen op waaraan de koning zich moest houden. De eerste was om zich te ontdoen van Piers Gaveston. Maar voor 1312 kwam Gaveston terug naar Engeland. Datzelfde jaar was Isabella zwanger van hun eerste kind. Om aan de baronnen te ontsnappen, vluchtten Edward en Gaveston naar het noorden, Isabella met zich meenemend. Ze lieten haar onbeschermd achter in York, terwijl Edward en Gaveston op een schip ontsnapten. Maar de baronnen waren niet boos op Isabella. Gaveston werd gevangen genomen en vermoord in de zomer van 1312. Dit betekende niet het einde van Isabella’s problemen, want Edward vond een nieuwe favoriet in Hugh le Despenser. In november werd hun eerste kind geboren, de toekomstige Edward III van Engeland. Maar Despenser haatte Isabella meer dan Gaveston. In 1321 was ze praktisch een gevangene. In 1324 had Edward al haar landerijen aan Despenser gegeven.