Punjistokken zouden worden geplaatst in gebieden waar vijandelijke troepen waarschijnlijk doorheen zouden lopen. De aanwezigheid van punji-stokken kon worden gecamoufleerd door natuurlijk kreupelhout, gewassen, gras, kreupelhout of soortgelijke materialen. Ze werden vaak verwerkt in verschillende soorten vallen; bijvoorbeeld een gecamoufleerde kuil waarin een soldaat zou kunnen vallen (het zou dan een trou de loup zijn).
Soms werd een kuil gegraven met punjistokken in de zijkanten die onder een hoek naar beneden wezen. Een soldaat die in de kuil zou stappen, zou zijn been onmogelijk kunnen verwijderen zonder ernstige schade op te lopen, en verwondingen zouden kunnen worden opgelopen door de simpele handeling van het voorover vallen terwijl men met zijn been in een smalle, verticale, met staken afgezette kuil staat. Dergelijke kuilen zouden tijd en zorg vergen om het been van de soldaat uit te graven, waardoor de eenheid langer geïmmobiliseerd zou blijven dan wanneer de voet gewoon zou worden doorboord, in welk geval het slachtoffer zo nodig per brancard of brandweerwagen zou kunnen worden geëvacueerd.
Andere aanvullende maatregelen zijn het coaten van de stokken met gif van planten, dierlijk gif, of zelfs menselijke uitwerpselen, waardoor infectie of vergiftiging bij het slachtoffer optrad na doorboord te zijn door de stokken, zelfs als de verwonding zelf niet levensbedreigend was.
Punji-stokken werden soms ingezet bij de voorbereiding van een hinderlaag. Soldaten die lagen te wachten tot de vijand voorbij kwam, staken punji-stokken in de gebieden waar men kon verwachten dat de verraste vijand dekking zou zoeken, zodat soldaten die naar dekking doken zichzelf konden doorboren.
Het punt van penetratie was meestal in de voet of het onderbeen. Punji-stokken waren niet per se bedoeld om de persoon die erop trapte te doden; soms waren ze specifiek ontworpen om de vijand alleen te verwonden en hun eenheid te vertragen of tot stilstand te brengen terwijl het slachtoffer naar een medische faciliteit werd geëvacueerd.