De Sargassozee wordt in de literatuur en de media vaak afgeschilderd als een gebied vol mysterie.
Ezra Pound’s “Portrait d’une Femme” opent met de regel: “Your mind and you are our Sargasso Sea”, waarmee wordt gesuggereerd dat de vrouw die in het gedicht wordt aangesproken een vergaarbak is van trivia en losstaande feiten.
De Sargasso Zee komt voor in klassieke fantasy-verhalen van William Hope Hodgson, zoals zijn roman The Boats of the “Glen Carrig” (1907), Victor Appleton’s Don Sturdy roman Don Sturdy in the Port of Lost Ships: Or, Adrift in the Sargasso Sea, en verscheidene korte verhalen. Jules Verne’s Twenty Thousand Leagues Under the Seas beschrijft de Sargasso Zee en geeft een verslag van het ontstaan ervan.
De Sargasso Zee wordt in fictie vaak (maar foutief) afgeschilderd als een gevaarlijk gebied waar schepen eeuwenlang vastzitten in het wier, niet in staat om te ontsnappen. De Doc Savage roman The Sargasso Ogre, gepubliceerd in 1933, speelt zich af in de Sargasso waar afstammelingen van Elizabethaanse piraten nog steeds leven. Een soortgelijk verhaal staat in Green Lantern (vol. 1) No. 3 (voorjaar 1942), “The Living Graveyard of the Sea,” waarin naar de Sargasso wordt verwezen als een verondersteld mythische plaats. Hier leven de nakomelingen van vele verschillende soorten schepen in utopische harmonie, totdat ze worden aangevallen door nazi’s die het in hun voordeel willen gebruiken. In de première-aflevering van Jonny Quest, “Mystery of the Lizard Men”, opereert een spionagekring in de Sargasso, onder de (niet-bestaande) vergane schepen. De film The Lost Continent van Hammer Film Productions uit 1968 (gebaseerd op een roman van Dennis Wheatley uit 1938, Uncharted Seas), toont reizigers die verdwaald zijn in een Sargassozee die vergeven is van vleesetend zeewier, reusachtige schaaldieren, en afstammelingen van Spaanse conquistadores die heersen over andere gevangen mensen, afstammelingen van degenen die eeuwen eerder in het wier vastzaten. Deze voorstellingen worden geparodieerd in The Venture Bros. seizoen 1 aflevering “Ghosts of the Sargasso”, dat zich afspeelt in de overlappende gebieden van de Sargasso Zee en de Bermuda Driehoek, en waarin vermeende piraten voorkomen wier schip een decennium vastzat in het sargassum en de geest van de piloot van een experimenteel vliegtuig dat in 1969 in zee neerstortte. De Sargassozee is een sleutellocatie in “Indiana Jones and the Sargasso Pirates”, een beperkte stripreeks van Dark Horse uit 1995. De avonturier, die verdwaald is op zee, spoelt aan bij een ‘stad’ van vergane schepen uit de maritieme geschiedenis, gevangen en gestut door dicht zeewier. De schepen worden bevolkt door piraten en het water krioelt van de palingen.
Wide Sargasso Sea (1966) van Jean Rhys is een herschrijving van Charlotte Brontë’s Jane Eyre vanuit het oogpunt van Bertha Mason.
De Sargasso Zee wordt genoemd in het Dead Can Dance nummer “All in Good Time” van hun 2012 album Anastasis.
De Sargasso Zee wordt genoemd in het refrein van Andrew Bird’s april 2016 nummer “Left-Handed Kisses” (met zangeres Fiona Apple).
Schrijver Charles Fort hypothetiseerde over het bestaan van wat hij de “Super-Sargasso Zee” noemde, een plek waar alle verloren dingen heengaan. De pop-cultuur wiki TV Tropes herkent een trope die deze zelfde naam draagt.
Eenmansband Lemon Demon verwijst ook naar de Super-Sargasso Sea in het nummer “Touch-Tone Telephone”, uitgebracht op zijn album Spirit Phone uit 2016.
De Sargasso Zee wordt genoemd in de 2019 aflevering “Silky Love” van de Radiolab podcast als de locatie waar palingen migreren en zich voortplanten.
De Sargasso Zee wordt gebruikt als een analogie in de roman Zen en de Kunst van het Motoronderhoud, door Robert M. Pirsig, door de hoofdpersoon wanneer hij beschrijft hoe retorica als discipline “een enorme Sargasso van gestagneerde logica” kan zijn.
In de video voor het nummer “Dashboard” van Modest Mouse uit 2007 is de Sargassozee te zien op een kaart en als de vermeende scène van de gebeurtenissen die in de video worden uitgebeeld.
Sargasso Sea is ook de titel van een album van gitaristen John Abercrombie en Ralph Towner dat in 1976 werd uitgebracht door ECM (ECM 1080)