Alfred Molina nasceu em 1953 em Londres, Inglaterra. A sua mãe, Giovanna (Bonelli), era cozinheira e faxineira italiana, e o seu pai, Esteban Molina, era um empregado de mesa e motorista nascido em Espanha. Estudou na Guildhall School of Music and Drama, Londres. O seu trabalho de palco inclui duas grandes produções do Royal National Theatre, “The Night of the Iguana” de Tennessee Williams (como Shannon) e “Speed the Plow” de David Mamet (como Fox), além de uma esplêndida actuação na “Art” de Yasmina Reza (a sua estreia na Broadway), pela qual recebeu uma nomeação para o Tony Award em 1998. Estreou-se no cinema em Indiana Jones and the Raiders of the Lost Ark (1981) e teve um bom papel em Letter to Brezhnev (1985) (como marinheiro soviético que passa uma noite em Liverpool), mas a sua estreia no cinema veio dois anos mais tarde, quando interpretou – supostamente – Kenneth Halliwell, o trágico amante do dramaturgo Joe Orton, em “Prick Up Your Ears” de Stephen Frears (1987). Foi também notável em Abril Encantado (1991), A Família Perez (1995) (como imigrante cubano), Anna Karenina (1997) (como Levin) e Chocolat (2000) (como presidente da câmara de uma pequena cidade francesa por volta dos anos 50, que tenta fechar uma loja de chocolate).