A Confederacy of Independent Systems foi mostrada pela primeira vez em Attack of the Clones. Este movimento, liderado pelo chanceler Palpatine, ganhou apoio e logo teve o apoio de milhares de sistemas solares. A República Galáctica temia que uma guerra começasse. O Conde Dooku e os líderes Separatistas estavam a preparar-se para uma guerra. Nute Gunray, líder da Federação do Comércio, deu milhares de dróides de batalha ao exército Separatista. Outros líderes, tais como Poggle the Lesser e San Hill, deram dinheiro e dróides à causa Separatista. No planeta Geonosis, o Conde Dooku encontrou-se com os líderes de companhias poderosas. O Conde Dooku fez a sua oferta e foi formada a Confederação de Sistemas Independentes. O Jedi Obi-Wan Kenobi ouviu a reunião e enviou um aviso à República. A República enviou um exército de clones recentemente criado para combater os dróides de batalha. Esta batalha sobre Geonosis deu início às Guerras de Clones. O Arquiduque Geonosiano Poggle the Lesser dá os planos de uma nova arma ao Conde Dooku. O Conde Dooku abandona o planeta e vai para Coruscant. Ele dá os planos a Darth Sidious assim como lhe diz que a guerra começou.