Krupa fez as suas primeiras gravações em 1927 com uma banda sob a liderança de Red McKenzie e o guitarrista Eddie Condon. Juntamente com outras gravações de músicos da cena jazz de Chicago, tais como Bix Beiderbecke, estas gravações são exemplos de jazz ao estilo de Chicago. As influências de Krupa durante este tempo incluíram Padre Ildefonse Rapp e Roy Knapp (ambos professores do seu), e os bateristas Tubby Hall, Zutty Singleton e Baby Dodds. Os rolos de pressão (arrastar um pau na cabeça do laço enquanto se mantém o ritmo com o outro pau) foram uma técnica bastante comum nas fases iniciais do seu desenvolvimento. Houve muitos outros bateristas (Ray Bauduc, Chick Webb, George Wettling, Dave Tough) que influenciaram a sua abordagem à bateria e outros instrumentistas e compositores como Frederick Delius que influenciaram a sua abordagem à música.
Krupa apareceu em seis gravações da banda Thelma Terry em 1928. Em Dezembro de 1934, juntou-se à banda de Benny Goodman, onde o seu trabalho de bateria o tornou uma celebridade nacional. O seu tom-tom interlúdio no sucesso “Sing, Sing, Sing” foram os primeiros solos prolongados de bateria a serem gravados comercialmente. Mas o conflito com Goodman levou-o a abandonar o grupo e a formar a sua própria orquestra pouco depois do concerto no Carnegie Hall, em Janeiro de 1938. Apareceu no filme Ball of Fire de 1941 no qual ele e a sua banda apresentaram uma versão alargada do sucesso “Drum Boogie” (composto por Krupa e Roy Eldridge), cantado por Martha Tilton e sincronizado por Barbara Stanwyck.
Em 1943, Krupa foi preso sob uma acusação de droga falsa. Isto resultou numa curta pena de prisão e em má publicidade. Gene separou a orquestra e regressou à banda de Goodman durante alguns meses. Quando Goodman queria que ele fosse numa digressão pela costa ocidental, Gene (compreensivelmente) optou por não o fazer. Depois juntou-se à banda de Tommy Dorsey durante vários meses e depois montou a sua próxima orquestra.
Como os anos 40 terminaram, Count Basie fechou a sua banda e Woody Herman reduziu a sua banda a um octeto. Em 1951, Krupa reduziu o tamanho da sua banda a uma dezena de elementos durante um curto período de tempo e a partir de 1952 liderou trios, depois quartetos, muitas vezes com Charlie Ventura e depois Eddie Shu em saxofone tenor, clarinete, e harmónica. Apareceu regularmente no Jazz nos concertos da Filarmónica. Nos anos 50, Krupa regressou a Hollywood para aparecer nos filmes The Glenn Miller Story e The Benny Goodman Story. Em 1959, foi lançada a biografia do filme The Gene Krupa Story; Sal Mineo retratou Krupa, e o filme incluía cameos de Anita O’Day e Red Nichols. Durante as décadas de 1950 e 1960, Krupa tocou frequentemente no Metropole, perto de Times Square, em Manhattan. Continuou a actuar em clubes famosos nos anos 60, incluindo o Showboat Lounge no noroeste de Washington, D.C. Com o colega Cozy Cole, Gene fundou em 1954 uma escola de música que prosseguiu até aos anos 60. Alguns dos alunos da escola incluíam Peter Criss dos KISS e Jerry Nolan do The New York Dolls. Doug Clifford de Creedence Clearwater Revival citou Krupa como inspiração.Krupa estava ainda muito ocupado no início dos anos 70 até pouco antes da sua morte. Isso incluiu vários concertos de reunião do Quarteto Benny Goodman original. A 17 de Abril de 1973, o Quarteto Gene Krupa, composto por Eddie Shu (tenor e clarinete), John Bunch (piano), Nabil Totah (baixo) e Krupa (bateria), gravou uma performance ao vivo na New School com a composição de Louis Prima “Sing, Sing, Sing”.
As suas composições que escreveu ou co-escreveu incluíam “Some Like It Hot” em 1939, “Drum Boogie”, “Boogie Blues”, a sua canção temática “Apurksody”, “Ball of Fire”, “Disc Jockey Jump” com Gerry Mulligan, “Wire Brush Stomp”, “Hippdeebip”, “Krupa’s Wail”, “Swing is Hee”, “Quit and Roll ‘Em” com Sam Donahue, e “How ‘Bout This Mess”.
Krupa-Rich drum battlesEdit
Norman Granz contratou Krupa e o baterista Buddy Rich para o seu Jazz nos concertos da Filarmónica. Os dois bateristas actuaram no Carnegie Hall em Setembro de 1952 e foi emitido por Verve como The Drum Battle. Os dois bateristas enfrentaram-se numa série de emissões de televisão e outros locais e tocaram frequentemente duetos semelhantes com o baterista Cozy Cole. Krupa e Rich gravaram dois álbuns de estúdio juntos: Krupa and Rich (Verve, 1955) e Burnin’ Beat (Verve, 1962).