La Confederación de Sistemas Independientes se mostró por primera vez en El ataque de los clones. Este movimiento, liderado por el canciller Palpatine, fue ganando adeptos y pronto contó con el apoyo de miles de sistemas solares. La República Galáctica temía que se iniciara una guerra. El Conde Dooku y los líderes separatistas se estaban preparando para una guerra. Nute Gunray, líder de la Federación de Comercio, entregó miles de droides de batalla al ejército separatista. Otros líderes, como Poggle el Menor y San Hill, dieron dinero y droides a la causa separatista. En el planeta Geonosis, el Conde Dooku se reunió con los líderes de las poderosas compañías. El Conde Dooku hizo su oferta y se formó la Confederación de Sistemas Independientes. El Jedi Obi-Wan Kenobi escuchó la reunión y envió una advertencia a la República. La República envió un ejército de clones recién creado para luchar contra los droides de batalla. Esta batalla en Geonosis dio comienzo a las Guerras Clon. El Archiduque Poggle el Menor de Geonosis entrega los planos de una nueva arma al Conde Dooku. El Conde Dooku deja el planeta y va a Coruscant. Le da los planos a Darth Sidious además de decirle que la guerra ha comenzado.