Aunque originalmente era un escaparate de piezas del Primer Imperio, la naturaleza de la colección del museo comenzó a cambiar con dos importantes donaciones. En 1957, Victorine Donop de Monchy donó al museo una importante colección de obras impresionistas que habían pertenecido a su padre, el doctor Georges de Bellio, médico de Manet, Monet, Pissarro, Sisley y Renoir, y uno de los primeros partidarios del movimiento impresionista. En 1966, el segundo hijo de Claude Monet, Michel Monet, legó al museo su propia colección de obras de su padre, creando así la mayor colección de cuadros de Monet del mundo. En 1985, Nelly Duhem, hija adoptiva del pintor Henri Duhem, donó al museo su gran colección de obras impresionistas y postimpresionistas (entre las que se encontraban varios Monet).
Jacque Carlu, entonces conservador del museo, construyó un espacio de exposición especial para la colección Monet en un nivel inferior del museo. Inspirada en la sala diseñada para los murales de los Nenúfares de Monet en el Museo de la Orangerie, la gran sala abierta permite a los visitantes ver una progresión de la obra de Monet, así como ver sus lienzos tanto de cerca como de lejos. Una de las piezas más destacadas del museo es Impresión, amanecer (Impression, Soleil Levant) de Monet, el cuadro del que tomó su nombre el movimiento impresionista. El cuadro fue robado del Museo Marmottan en 1985, pero se recuperó cinco años después y volvió a la exposición permanente en 1991.
Desde 1975, el museo ha organizado dos exposiciones anuales dedicadas a un individuo o a colecciones, entre las que se encuentran Toulouse-Lautrec en 1976, Boilly en 1984, Daumier en 1989, Goya en 1990, Boldini en 1991 y Pissarro en 2017. Las pinturas del museo de la última etapa de la carrera de Claude Monet se expusieron en el Museo de Arte de Nueva Orleans y en los Museos de Bellas Artes de San Francisco en 1995. Las obras viajaron posteriormente al Walters Art Museum, al San Diego Museum of Art y al Portland Museum of Art en 1998-1999.