El lipopolisacárido (LPS) es el principal componente molecular de la membrana externa de las bacterias Gram negativas y sirve como barrera física que proporciona a la bacteria protección frente a su entorno. El LPS también es reconocido por el sistema inmunitario como un marcador para la detección de la invasión de patógenos bacterianos, responsable del desarrollo de la respuesta inflamatoria y, en casos extremos, del shock endotóxico. Debido a estas funciones, la interacción del LPS con las moléculas de unión al LPS atrae una gran atención. Un ejemplo de estas moléculas son los péptidos antimicrobianos (AMP). Se trata de un amplio repertorio de péptidos codificados por genes y producidos por organismos vivos de todo tipo, que forman parte de la inmunidad innata que los protege de la invasión de patógenos. Se sabe que los AMPs interactúan con los LPS con gran afinidad. Las propiedades biofísicas de los AMP y su modo de interacción con los LPS determinan su función biológica, la susceptibilidad de las bacterias a ellos, así como la capacidad de los LPS para activar el sistema inmunitario. En esta revisión se discutirán los estudios recientes sobre los mecanismos moleculares que subyacen a estas interacciones, sus efectos sobre la resistencia de las bacterias a los AMPs, así como su potencial para neutralizar el shock endotóxico inducido por los LPS.