Si sa poco su come la contea di Jones abbia ottenuto il soprannome “Lo Stato Libero di Jones”, ma ci sono state molte voci e teorie. Una di queste, con l’appoggio della pubblicazione nel Magazine of American History, era un articolo scritto da G. Norton Galloway, storico del Sesto Corpo d’Armata, intitolato “Una Confederazione all’interno di una Confederazione”. L’unico problema con la sua storia è che non c’è alcuna citazione di autorità e il signor Galloway non ha lasciato alcuna informazione per contattarlo. Egli afferma nel suo articolo che nella seconda parte dell’anno 1862, una convenzione si riunì a Ellisville, Jones County, Mississippi, e passò un’ordinanza di secessione dallo Stato del Mississippi e dagli Stati Confederati d’America. Egli riporta persino le parole esatte dell’ordinanza: “Considerando che lo Stato del Mississippi ha ritenuto opportuno ritirarsi dall’Unione Federale per ragioni che appaiono giustificabili, e che noi, cittadini di Jones, rivendichiamo lo stesso diritto, ritenendo che le nostre rimostranze siano sufficienti a causa di una legge ingiusta approvata dal Congresso degli Stati Confederati d’America, che ci costringe ad andare in parti lontane, ecc, ecc, quindi, sia deciso. Che noi rompiamo l’unione finora esistente tra la contea di Jones e lo Stato del Mississippi, e proclamiamo la nostra indipendenza dal suddetto Stato, e dagli Stati Confederati d’America” e chiediamo a Dio Onnipotente di testimoniare e benedire l’atto.”
In parte a causa della scarsa popolazione della contea di Jones, la maggioranza sembrava essere contro la secessione dello Stato, e la contea di Jones elesse il sospetto anti-secessionista J.D. Powell per rappresentare Jones alla Convenzione della Secessione. Quando venne il momento di votare, Powell votò per la secessione. Powell fu impiccato in effigie e maltrattato così tanto che non osò tornare nella contea per qualche tempo.
La contea di Jones inviò truppe alla Confederazione. Tre compagnie complete e gran parte di altre quattro furono formate ai suoi confini. Alcuni disertarono e tornarono nella contea di Jones sostenendo che non avrebbero combattuto per gli uomini ricchi mentre loro erano a casa a divertirsi. Nell’ultima parte del 1862 fu formata la famosa “Newt Knight Company”, con Newt Knight come capitano, Jasper Collins primo tenente e W. W. Sumrall secondo tenente. Molti di coloro che disertarono dall’esercito confederato si unirono a questa compagnia, che quando fu organizzata contava circa sessanta uomini, ma più tardi fu portata a circa centoventicinque. I suoi membri provenivano da varie parti del paese. Il signor Galloway sostiene che Newt Knight fu il presidente della secessione della contea di Jones dallo Stato del Mississippi. La compagnia fece delle incursioni contro le forze confederate, e si dice che la compagnia giurò fedeltà all’esercito dell’Unione. Avevano un quartier generale segreto sul fiume Leaf e combatterono molte battaglie a Laurel e Ellisville.
Ci sono altre teorie sul soprannome. È vero che la contea di Jones è stata per un periodo di tempo senza amministrazione intorno al periodo della guerra civile a causa della piccola popolazione e della mancanza di paga per gli amministratori. Si suggerisce che un membro della contea (non è chiaro chi) andò a Jackson a cavallo e fece il giuramento e tornò indietro e seccò la contea dallo stato. Un’altra versione dell’origine del titolo è che fu dato alla contea dai cittadini delle contee vicine che vivevano vicino alla costa del Golfo e lungo la linea di quella che ora è la ferrovia Mobile e Ohio, a causa dell’intera libertà dei cittadini di Jones County dalle regole arbitrarie della società e dai vincoli della moda riconosciuti altrove. Andavano in chiesa a piedi nudi, si vestivano come meglio credevano, e portavano le loro pistole da usare nel caso in cui qualche selvaggina potesse incrociare il loro cammino.
La leggenda di Newt Knight ha generato la maggior parte delle voci che circondano “The Free State of Jones”, ma, voci a parte, le auto della polizia di Ellisville ancora oggi portano questo soprannome.