WPROWADZENIEHematoksylina i eozyna (H&E) barwniki były używane przez co najmniej sto lat i są nadal niezbędne do rozpoznawania różnych typów tkanek i zmian morfologicznych, które stanowią podstawę współczesnej diagnostyki nowotworów. Barwnik ten jest niezmienny od wielu lat, ponieważ dobrze współpracuje z różnymi utrwalaczami i wykazuje szeroki zakres cech cytoplazmatycznych, jądrowych i macierzy pozakomórkowej. Hematoksylina ma głęboki niebiesko-purpurowy kolor i barwi kwasy nukleinowe w wyniku złożonej, nie do końca poznanej reakcji. Eozyna jest różowa i barwi białka niespecyficznie. W typowej tkance, jądra są zabarwione na niebiesko, podczas gdy cytoplazma i macierz zewnątrzkomórkowa mają różny stopień zabarwienia. Dobrze utrwalone komórki wykazują znaczne szczegóły wewnątrzjądrowe. Jądra wykazują różne, specyficzne dla typu komórki i typu nowotworu wzory kondensacji heterochromatyny (barwienie hematoksyliną), które są diagnostycznie bardzo ważne. Nukleoleole barwią się eozyną. Jeśli obecne są obfite polirybozy, cytoplazma będzie miała wyraźny niebieski odcień. Strefa Golgiego może być wstępnie zidentyfikowana przez brak barwienia w regionie obok jądra. Tak więc, barwienie ujawnia obfite informacje strukturalne, z określonymi implikacjami funkcjonalnymi. Ograniczeniem barwienia hematoksyliną jest to, że jest ono niekompatybilne z immunofluorescencją. Użyteczne jest jednak barwienie jednej seryjnej sekcji parafinowej z tkanki, w której będzie wykonywana immunofluorescencja. Hematoksylina, zazwyczaj bez eozyny, jest przydatna jako przeciwbarwnik dla wielu procedur immunohistochemicznych lub hybrydyzacyjnych, które wykorzystują substraty kolorymetryczne (takie jak fosfataza alkaliczna lub peroksydaza). Ten protokół opisuje barwienie H&E wycinków tkanek i komórek.