Substytucja odnosi się do zastąpienia jednego aminokwasu innym aminokwasem w białku lub zastąpienia jednego nukleotydu innym w DNA lub RNA. Substytucje generalnie powodują – lub zawsze powodują – albo polimorfizm, czyli różnicę między jedną osobą, jednym osobnikiem, w populacji lub innej, albo specjalny rodzaj polimorfizmu, który nazywamy mutacją. W każdym z tych przypadków wszystkie osobniki w populacji miały pierwotnie taką samą sekwencję genu. Doszło do substytucji, które spowodowały zmianę w sekwencji DNA, co spowodowało zmianę w sekwencji RNA, która następnie mogła spowodować zmianę w sekwencji aminokwasów. Kiedy tak się dzieje, zmiana sekwencji DNA lub sekwencji aminokwasów, lub obu, może nie mieć żadnego wpływu na białko, w którym to przypadku substytucja jest łagodna i nie ma żadnego funkcjonalnego efektu. W innych przypadkach, jeśli zmienia funkcję białka, wtedy będzie to obserwowane jako albo funkcjonalny polimorfizm, coś, co zwiększa efektywność produktu białkowego, a zatem będzie ewolucyjnie wybrane dla, lub jest złe – szkodliwe – w tym przypadku osoba może umrzeć wcześnie i dostać ewolucyjnie wybrane przeciwko. Substytucje, które prowadzą do mutacji, które prowadzą do szkodliwego wyniku, czyli organizm ma trudności z życiem lub umiera wcześnie, te nazywamy mutacjami, ale są one wynikiem pewnego rodzaju substytucji.
Christopher P. Austin, M.D.