Po przybyciu na Animal Junction, bracia Kratt (Chris i Martin Kratt) wychylają się przez okno i wzywają Zoboomafoo (lub „Zoboo” w skrócie, a czasami „Zob”), pokazane w segmencie live-action jako rzeczywisty lemur (Jovian) skaczący przez pole, aby do nich dotrzeć. Kiedy lemur osiąga Animal Junction, nie będzie rozmawiać z braćmi Kratt, dopóki nie dadzą mu przekąskę, ogólnie lemur odpowiednie jedzenie jak fasola garbanzo, słodki ziemniak lub plasterki mango. Po tym, jak skończył jeść jego przekąskę, on natychmiast beknie, mówiąc: „Przepraszam”, a następnie obraca się na gramofonie, krzycząc: „Zoboomafoo-oo-oo-oo!”, w którym momencie staje się mówiącym lemur marionetka (głos Robertson). On następnie prowadzi do głównego segmentu odcinka, opisując „Mangatsika!” (Malgaski słowo dosłownie oznaczające „zimno”, ale używane w serii, aby oznaczać „cool”) zwierzę, które widział na swojej drodze do Animal Junction. Jak on opisuje zwierzę, piosenka jest odtwarzana, „Kto to może być?”, podczas gdy kreskówka pokazuje cechy „tajemniczego zwierzęcia”. Pod koniec piosenki Chris i Martin próbują odgadnąć, jakie zwierzę opisał Zoboo, a tajemnica zostaje odkryta, gdy zwierzę lub zwierzęta dotrą do Animal Junction.
Każdy odcinek ma jakiś temat. Na przykład, małe zwierzęta, przerażające zwierzęta lub znaczenie zabawy. Przybycie „tajemniczego zwierzęcia”, zwykle używane jako ekspozycja, prowadzi Zoboo, Chris i Martin do rozmowy o zwierzęciu. Przynajmniej raz w każdym odcinku (dwa razy w większości odcinków), Zoboo mówi, że jakieś wydarzenie w Animal Junction przypomina mu o czasie w Zobooland, gdzie opowiedzieć historie o swoich najlepszych przyjaciół w Zobooland, takich jak Narchi (anteater-jak stworzenie), Gooble (niedźwiedziopodobne stworzenie, które je goobleberries), Sensit (lemur, który zazwyczaj bawi się w kółko), Wiggy Waxwing (ptakopodobne stworzenie, które lubi śpiewać i jeść makaron korzeniowy), Green Puppy (zielony szczeniak, jak sama nazwa wskazuje), Slimantha (stworzenie przypominające salamandrę), Noggin Drill (stworzenie przypominające kreta, które używa swojego rogu w kształcie wiertła), Snow Lemur (lemur, który mieszka na górze), Baby Zoboomafooasaurus i Mama Zoboomafooasaurus (dinozaury, którzy pojawiają się w CGI, że zwierzęta często grać na), Buggly (bug, że Zoboo jeździ na), Fibby (morskie stworzenie z kilku części, w tym macki i nogi kraba) i Cy (lewitujące jednooki squid wprowadzony w drugim sezonie). Segmenty te są animowane, przy użyciu animacji gliny i funkcji odrębnych głosów dla każdej character.
Po pierwszej historii Zobooland, Zoboo, Chris i Martin otrzymują list od Pomocników zwierząt (Jackie w pierwszym sezonie i Amy w drugim sezonie), którzy pokazują dzieciom, jak pomóc zwierzętom. Prowadzi to do Chrisa i Martina wychodzi odwiedzić stworzeń związanych z tematem, zawsze zaczynając od piosenki „Going to the Closet” śpiewanej przez Zoboo (i czasami postacie z Zobooland). Na koniec każdego odcinka, Zoboo i bracia podpisują się śpiewając „Animal Friends”, piosenkę, która wyjaśnia, dlaczego zwierzęta są przyjaciółmi dla wszystkich, mimo że są różnych gatunków. W końcu Zoboo zamienia się z powrotem w normalnego lemura i wraca do swojego domu na Madagaskarze. Chris i Martin również opuszczają Animal Junction, aby lepiej zademonstrować temat dnia, podróżując do regionu, często w Indiach lub Afryce, aby odwiedzić tamtejsze stworzenia.
Przed napisami końcowymi każdego odcinka, dzieci pokazują i opowiadają widzom o różnych zwierzętach i zwierzętach domowych, które mają, a zrzeczenie się odpowiedzialności jest odtwarzane, mówiąc widzom, że powinni być ostrożni ze zwierzętami, które spotykają. Następnie Chris i Martin wspominają o faktach dotyczących zwierząt, które prowadzą Zoboo do żartu. Przykład: „Knock knock knock. Kto tam jest? Pantera. Jaka pantera? Pantera nie ma spodni, idę popływać!”. Zastrzeżenie i żart zostały usunięte w przypadku emisji poza telewizją PBS (z wyjątkiem oglądania na żądanie i PBS Kids Sprout).